Il complesso della chiesa e del convento di San Francesco risale al 1523, quando i Frati Minori Osservanti di San Francesco fondarono il primo nucleo del convento. Passato di mano dagli Osservanti ai Riformati, vi fu aggiunta dal 1526 la chiesa, consacrata al culto del Santo di Assisi. Un portico con doppio loggiato consente l'accesso alla cappella di Santa Elisabetta e alla chiesa ad una navata. L'altare maggiore, sostituito al precedente nel 1726, recava al centro la statua marmorea raffigurante San Francesco dello scultore Pompeo Franchi, ora posta all’esterno.
